Областная прозектура с 1925 года базировалась в патологоанатомическом корпусе Омского медицинского института. Систематически проводились вскрытия, исследования операционного и биопсийного материала, которые в основном были приурочены к учебному процессу.
В 1938 году кафедра патологической анатомии ОГМИ получила новое помещение в анатомическом корпусе, прозектуру возглавил ученик академика А. И. Абрикосова профессор Илларион Сергеевич Новицкий, который внес большой вклад в становление отделения. Он стал основоположником омской школы патологоанатомов, в которой наметилась четкая клинико-анатомическая направленность. В послевоенные годы постепенно возрастал объем исследований биопсийного и операционного материала. С 1949 года начинают проводится клинико-анатомические конференции. В этот период стали постоянными выезды патологоанатомов в районы области.

И.С. Новицкий

В 1964 году должность заведующего отделением занял ученик И. С. Новицкого профессор Антон Самуилович Зиновьев, который продолжил развитие школы, обеспечил совершенствование ее организации, поднял уровень патологоанатомической службы Омской области. В тот период отделение освоило все существовавшие методы обработки биопсийного материала, в отделении готовились и работали квалифицированные лаборанты-гистологи и врачи.

А.С. Зиновьев

После ввода в эксплуатацию здания Областной клинической больницы на улице Березовой в 1974 году был открыт и новый корпус прозектуры, возглавил ее талантливый врач Дмитрий Николаевич Молодых. С этого же времени вводится система подготовки врачей-патологоанатомов через интернатуру, патологоанатомическое отделение становится консультативным и организационно-методическим центром Омской области.

Д.Н. Молодых

В 1979 году по рекомендации главного патологоанатома Омской области профессора А. С. Зиновьева заведующим патологоанатомическим отделением назначается опытный прозектор Подойников Михаил Владимирович внесший большой вклад в развитие специальности и воспитавший за годы работы семнадцать врачей, большинство из которых являются в настоящий момент заведующими отделениями в Омске и других городах России. С 2007 года Михаил Владимирович является главным внештатным патологоанатомом Министерства здравоохранения Омской области.

М.В. Подойников

В течение всего периода своего существования коллектив отделения решал следующие задачи: подготовка кадров, внедрение современных форм организации труда и новых методик при работе с биопсийным и секционным материалом, техническое перевооружение, привлечение врачей к научной работе.
С 2013 года отделение возглавляет Павлов Алексей Вячеславович.
В связи с постоянным увеличением количества операционного и биопсийного материала возникла потребность в кадрах лаборантов-гистологов, большинство из которых воспитала старший лаборант Букреева Агарь Титеровна, проработавшая в отделении 46 лет.

Старший лаборант отделения Букреева А.Т., 1978 год

Коллектив отделения, 1985 год